安徽金种子酒业股份有限公司是金种子集团的控股子公司，前身为阜阳县酒厂，始建于1949年7月，金种子股票于1998年在上交所上市。公司先后荣获“全国绿色食品示范企业”“全国十佳新锐上市公司”“全国实施卓越绩效模式先进企业”“全国轻工业信息化与工业化深度融合示范企业”等100多项荣誉称号。
金种子酒业始终坚持打造中国白酒实力品牌。现有“金种子”“醉三秋”“种子”“和泰”“颍州”等五大白酒品牌。其中，“金种子”“醉三秋”两个商标荣获，“颍州佳酿”被商务部认定为“中华老 字号”，“金种子”牌、“种子”牌、“醉三秋”牌、“颍州”牌系列白酒，是国家地理标志保护产品。“金种子”品牌价值达173.46亿元，荣登第八届华樽杯中国酒类品牌价值前30强。目前主要产品有：金种子馥合香馫20、馫15、馫9；醉三秋1507；徽蕴金种子6年、8年、10年、12年；柔和大师酒；柔和种子酒；柔和经典种子酒；地蕴醉三秋、天蕴醉三秋等。2020年8月上市的金种子馥合香以“芝头、浓韵、酱尾”的“一口三香”独特风格，在白酒行业掀起了强劲的馥香热潮，打造了安徽次高端白酒品牌。
金种子地处淮河支流--颍河之滨，这里自古素有“名酒之乡”的美誉。醉三秋酒是阜阳特产，曾于1987年荣获国家轻工部部优产品，其酿造历史可追溯到魏晋时期，其品名起源于公元265年“刘伶一醉三秋”的传说，迄今已有1700多年。金种子酿酒历史悠久，文化源远流长，与中原文明、黄淮文明一脉相承，底蕴深厚。金种子明代古窖池被列入安徽省重点文物保护单位，“醉三秋酒传统酿造技艺”入选安徽省第四批省级非物质文化遗产名录。
金种子坚持“绿色、科技、低碳、人文、智能”的发展理念，投资1.28亿元建设了亚洲单体面积大、单位面积产值高的灌装车间，建立了陈坚院士工作站、博士后工作站、CNAS国家实验室等科研平台，独创物理恒温窖藏技术，首创柔和型白酒新工艺，制定的《柔和型白酒》等六项标准被安徽省质量技术监督局公布为安徽省地方标准。公司推进管理数字化、酿造生态化、装备智能化建设，投资20多亿元建设的金种子文化园、品控研发中心和白酒生态酿造科研基地，装备智能化程度处于行业水平。
金种子积极履行社会责任，打造爱心品牌，致力妇女儿童、爱心助学、抗震救灾、扶贫济困等各类公益慈善事业，上市以来，累计捐款捐物逾3亿元，赢得社会各界广泛赞誉，继在全国白酒行业被国家民政部授予“中华慈善奖”之后，又被中华慈善总会授予“中华慈善突出贡献奖”，荣获“中国食品企业社会责任金鼎奖”“中国食品企业社会责任百强企业”。
有文史专家考证认为，金种子酿酒老窖池是一处规模较大、遗址保存较好的明代酿酒窖池，应是明代侯大升酱园厂酿酒作坊--大升酒坊遗址。
该酒坊为山西省高平县侯大升所开设。据史料记载，明正德年间，晋商侯大升从山西省高平迁徙颍州，生产经营酱菜、醋、酒等。门面开的是酱菜店，内宅设有酱菜坊、醋坊、酿酒坊等加工作坊。
当时，因酿酒窖池用地面积大，用水也较多，侯大升酿酒作坊迁址颍州城外的颍河码头边，取颍河之水酿酒，立字号为“大升酒坊”。晚清时期，颍河码头因水患频发而逐渐沦落、荒废，大升酒坊的窖池也因颍河多次决堤泛滥被泥沙淹埋，侯大升酿酒作坊被迫迁址于地势较高的龙王堂集。
侯大升酱园经营白酒与酱菜，至清初已雇工50人，资金达白银两万多两。清乾隆年间迁移东顺河街口，立店号“大升酱园”。大升酱园和大升酒坊，到晚清侯治正掌管时期，白酒和酱菜畅销安徽、河南、江苏、山东各地，享有极高声誉。
至民国时期，侯大升酱园和酒坊的股东多至几十家，历经兵燹及土匪“老洋人”几次陷城、日寇飞机轰炸的浩劫，酱园厂迭成灰烬，后却逐渐恢复。民国二十九年至三十四年（1940--1945），山东、河南大部分地区沦陷，皖北仅存阜阳、界首等地为国统区，鲁苏豫皖边区政府设在临泉，沙河警备司令部置于界首。李仙洲、于学忠、何柱国等部队驻扎阜阳，山东、江苏流亡省政府也先后来到阜阳。阜阳成为国统区商品集散地，粮坊、杂货行、酿酒行业等呈现出异样的繁荣的景象，大升酒坊也日渐兴隆。解放后，大升酒坊与蕴泰酒坊合营成立阜阳县酒厂。1994年注册“金种子”商标，1996年以来，“金种子”商标连续多次蝉联安徽省商标，荣获“全国十大公众喜爱商标”，“金种子”品牌三次入围中国品牌500强。“金种子”牌白酒在全国同行业率先通过国家地理标志保护产品认证、ISO9001质量体系认证，被中国绿色食品发展中心认定为绿色食品，荣获安徽省三绿工程畅销品牌，多次被评为安徽省产品。
2021年度
一、金种子酒业酒体设计中心荣获全国“安康杯”优胜班组荣誉称号
元月15日下午，阜阳市总工会党组书记、副房继红，二级调研员吴燕一行到金种子酒业举行授牌仪式。金种子酒业酒体设计中心荣获全国“安康杯”竞赛优胜班组荣誉称号。金种子酒业总经理张向阳，公司领导张金星、彭兵等参加授牌仪式。
二、金种子馥合香荣膺八项大奖
4月9日，在中国酒业协会主办的第十六届中国国际酒业博览会上，金种子馥合香斩获中国酒类新品高奖--“青酌奖”，这是本次评选活动中获奖的安徽白酒。
与此同时，金种子馥合香全年分获2020年度爆款奖、中国酒业金地标奖、“中国酒业年度新品”、第2届酒业青云奖“年度十大新名酒”、中国食品工业协会科学技术奖、安徽特色伴手礼、“黄淮流域典型风格产品”奖等7项大奖。
三、新产品“柔和大师”上市
4月16日，“柔和大师”上市发布会在阜举行，优化了公司产品结构，极大地推动了柔和系列产品创新升级，成为金种子拓展大众名酒市场的新增长点。
四、金种子集团工会换届，选举产生新一届领导班子
7月16日上午，金种子集团工会第二次会员代表大会隆重举行，吴永彬当选为集团工会。
五、中国共产党安徽金种子集团有限公司第三次代表大会胜利召开
7月23日，中国共产党安徽金种子集团有限公司第三次代表大会在集团总部隆重召开。
经党委三届一次会议表决，选举贾光明为金种子集团第三届党委书记，选举储继良为第三届党委副书记、第三届书记。
六、金种子集团用工改革方案顺利实施
7月31日，金种子集团第二届职工代表大会隆重召开，来自集团各单位的167名职工代表听取并审议了《安徽金种子集团有限公司深化企业用工改革工作方案（草案）》。金种子集团党委书记、董事长贾光明出席会议并讲话。
大会以无记名投票方式，全票表决通过了《安徽金种子集团有限公司深化企业用工改革工作方案》。
七、金种子开窖节暨酒文化博物馆开馆仪式隆重举行
9月16日上午，2021金种子馥合香手酿开窖节暨酒文化博物馆开馆仪式在金种子酒文化广场隆重举行。
阜阳市政府副市长郑久坤出席仪式并讲话。阜阳市人大常委会副主任王显义，阜阳市政协副、市工商联聂磊出席并为金种子酒文化博物馆揭牌。
八、超200000CC！金种子集团多年组织员工无偿献血奉献社会
10月29日上午，金种子员工爱心献血活动在金种子集团总部再次启动，共67人参与献血。至此，金种子集团员工无偿献血总量已超200000CC。
九、第六届徽商奥斯卡年度盛典举行 贾光明出席并作主旨演讲
11月26日，2021徽商高质量发展论坛暨“金种子·馥合香”第六届徽商奥斯卡年度盛典颁奖典礼在合肥举行，金种子集团党委书记、董事长贾光明出席盛会，全国劳动模范、国家白酒评委、金种子酒业总工程师杨红文当选“十大徽商名匠”，金种子酒业当选“十大徽商喜爱品牌”，受到大会的隆重表彰。
十、作为中国徽菜产业发展大会指定用酒 金种子馥合香闪耀徽州
12月30日上午，以“皖美好味道，徽菜行天下”为主题的中国（黄山）徽菜产业发展大会暨徽菜美食嘉年华开幕式在屯溪隆重举行，金种子馥合香为本次大会指定用酒。